本校以心靈環保為核心價值，設有人文社會學群及佛教學系。學生約數百人，實施「全住宿、小班制」，校園猶如「大家庭」氛圍，建構自主且融和的學習 環境，培養跨領域學科素養、關懷生命、奉獻社會的優秀人才。
佛教學系成立於2007年，包括學士班、碩士班及博士班的完整學制。佛教學系延聘畢業自國內外知名大學之佛學相關專業專兼任教授20多位，提供完整而深入之佛教研究與實踐課程。法鼓佛教學系延續中華佛學研究所30多年辦學經驗與教學、研究、圖書等資源，為享譽國內外重要的佛教教學大學之一。
人文社會學群成立於2015年，設有「生命教育碩士學位學程」、「社會企業與創新碩士學位學程」。生命教育碩士學位學程特色：體悟生活智慧，創發生命格局；生命觀照與省思；跨文化多元視野；安頓自他身心。社會企業與創新碩士學位學程特色：以法鼓山心靈環保理念為核心，建設人間淨土為己任。培養社會跨領域議題倡議，重視社區與環境永續發展及社會企業博識專才。由自我省思與認識自我，厚植內在能量，拓展資源連結與提升公益行動能力。符合社會需求之課程設計，兼具理論與實務操作。