福建农林大学的前身是成立于1936年的福建协和大学农科和成立于1940年的福建省立农学院。1952年，两大文脉汇集成立福建农学院。1958年秋，省委省政府以福建农学院森林系为基础，成立福建林学院。2000年10月，原福建农业大学和原福建林学院合并组建新的福建农林大学。

学校设有20个以全日制本科生和研究生培养为主的学院以及1个独立学院，现有全日制本科生2.2万人，研究生6000多人。拥有本科专业81个，获批卓越农林人才试点专业8个、国家一流本科专业8个、国家级专业综合改革试点项目2个、国家级特色专业9个、国家级实验教学示范中心2个、国家级大学生校外实践教育基地2个、国家级精品在线开放课程14门、国家虚拟仿真实验教学项目4个。学校入选教育部首批创新创业50强高校，全国高校实践育人创新创业基地。在“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛和“创青春”全国大学生创业大赛中，先后七次捧得“优胜杯”。

学校现有教职工3069人，专任教师1787人，有中国科学院院士1人、全国杰出专业技术人才2人，国务院学科评议组成员4人，教育部“长江学者”8人，万人计划人才8人，国家杰出青年科学基金获得者5人，国家优秀青年科学基金获得者7人，国家百千万人才工程人选13人，国家级有突出贡献的专家9人，科技部创新人才推进计划人选8人，教育部新世纪优秀人才支持计划5人，享受国务院特殊津贴31人。拥有国家级教学团队2支、教育部创新团队1支、科技部“创新人才推进计划”创新团队2支和农业部创新团队2支、国家林业和草原局科技创新团队1支，1个基地入选国家“高等学校学科创新引智计划”（“111”计划）。

学校现有12个博士学位授权一级学科，27个硕士学位授权一级学科，11个博士后科研流动站。有1个国家重点学科、1个国家重点培育学科、2个农业农村部重点学科和7个国家林草局重点学科。在全国第四轮学科评估中，有17个学科进入榜单，其中植物保护、林学、生态学和风景园林学4个学科进入前10%-20%。6个学科入选福建省高峰学科，12个学科入选福建省高原学科。

学校建有省部共建国家重点实验室1个、省部共建2011协同创新中心1个、国家工程技术研究中心2个、国家地方联合工程实验室（研究中心）2个、教育部国际合作联合实验室1个、教育部重点实验室（工程研究中心）4个、农业农村部重点实验室2个、国家林业和草原局重点实验室3个。“十二五”以来，学校主持科研计划项目5000多项，科研经费超15亿元，获得国家及部省级科技成果奖100余项，其中国家科技进步奖4项。在全球破译小菜蛾基因组、菠萝基因组、甘蔗基因组，首次解析了植物蓝光受体原初光反应的分子机制。